Есть большое количество микроорганизмов и на коровьем вымени. Идентифицированы 137 видов и подвидов микробов , которые могут быть связаны с молочной железой коровы. Некоторые из них являются частью нормальной флоры и, за редким исключением, не вызывают мастит. Наоборот, они могут защитить вымя от инфекции , вызываемые патогенными бактериями.
Несколько других микроорганизмов, однако, может привести к инфекции в молочных железах. Наиболее распространенным, те , которые вызывают около 90% от мастита инфекций. Существуют инфекционные микроорганизмы и экологические микроорганизмы. Зараженные коровы являются основным источником инфекционных микроорганизмов, которые выживают и пролиферировать на коже , так и на доильных ранах. Они состоят из Streptococcus agalactiae , стафилококк и стрептококк dysgalactiae . Экологические микроорганизмы (Escherischia палочка и другие колиформы, Streptococcus uberis ) не остаются на соске. Скорее всего , их присутствие указывает на высокую степень загрязнения почвы, подстилки, а также воды ,вызванных, в частности, навозом.